Los tamaños de los archivos FLAC varían según el contenido de audio, pero normalmente son más grandes que los archivos MP3. El tamaño promedio de un archivo FLAC puede oscilar entre 20 y 50 megabytes (MB) por minuto de audio, mientras que un archivo MP3 de la misma longitud puede oscilar entre 3 y 5 MB. Además, el tamaño de un archivo FLAC puede verse afectado por la frecuencia de muestreo, la profundidad de bits y la cantidad de canales.