Utiliza un editor de texto.
Los archivos PDB son archivos de texto sin formato, por lo que puedes abrirlos con cualquier editor de texto, como el Bloc de notas o WordPad. Sin embargo, no podrás ver la estructura 3D de la molécula en un editor de texto.
Utilice un visor PDB.
Hay muchos visores de PDB diferentes disponibles, tanto gratuitos como comerciales. Algunas opciones populares incluyen:
- PyMOL: Un visor de PDB gratuito y de código abierto con una amplia gama de funciones.
- VMD: Un visor de PDB gratuito y de código abierto que es particularmente adecuado para visualizar moléculas grandes.
- Quimera: Un visor de PDB comercial conocido por su interfaz fácil de usar y su amplio conjunto de funciones.
Para abrir un archivo PDB en un visor de PDB, simplemente seleccione el elemento de menú Archivo> Abrir y busque el archivo PDB que desea abrir. Luego, el visor PDB cargará el archivo y mostrará la estructura 3D de la molécula.
Utilice un navegador web.
También hay varios navegadores web que pueden mostrar archivos PDB. Algunas opciones populares incluyen:
- Banco de datos de proteínas RCSB: El sitio web oficial del Protein Data Bank, que alberga una gran colección de archivos PDB.
- Visor Mol*: Un visor de PDB basado en web gratuito y de código abierto que le permite ver la estructura 3D de las moléculas en su navegador web.
- JSmol: Un visor de PDB gratuito y de código abierto basado en Java que le permite ver la estructura 3D de las moléculas en su navegador web.
Para abrir un archivo PDB en un navegador web, simplemente copie y pegue el ID de PDB en la barra de búsqueda del navegador web. Luego, el navegador web cargará el archivo PDB y mostrará la estructura 3D de la molécula.