En comparación, el analista de sistemas puede desempeñar roles muy diferentes bajo el enfoque de creación de prototipos. Un papel típico es asumir una capacidad más facilitadora. Bajo esta función, el analista de sistemas trabaja para facilitar la interfaz de otros miembros del equipo de desarrollo del proyecto, como los usuarios finales y el personal de TI. Otras veces, el analista de sistemas puede desempeñar un papel más activo en el desarrollo real del prototipo, como desarrollar diseños de pantalla o planes de prueba para el sistema prototipo.
En última instancia, si un analista de sistemas desempeña un papel más facilitador o un papel más orientado al desarrollo bajo el enfoque de creación de prototipos depende del tipo de estrategia de creación de prototipos que se utilice. Para la creación de prototipos iterativos, en los que las iteraciones de desarrollo de sistemas son incrementales, puede ser necesario un papel activo que abarque tanto actividades de facilitación como de desarrollo. Para la creación de prototipos evolutivos, en los que el prototipo se desarrolla de forma independiente pero se refina y modifica progresivamente según la retroalimentación del usuario final, es probable que el analista de sistemas desempeñe un papel más facilitador.