Las ranuras y tarjetas PCI-e tienen más pines y conectores más grandes que las ranuras y tarjetas PCI. PCI-e también es eléctricamente diferente de PCI:los dispositivos PCI funcionan a 3,3 V, mientras que los dispositivos PCI-e pueden funcionar a 3,3 V o 12 V. No son eléctricamente compatibles e intentar utilizar uno en el otro puede dañar gravemente el hardware.