El sistema de archivos utilizado por las tarjetas de memoria SDXC es exFAT (Tabla de asignación de archivos extendida). Este sistema de archivos fue desarrollado por Microsoft y está diseñado para usarse con tarjetas de memoria flash, como las tarjetas SDXC. exFAT admite archivos de más de 4 GB y se puede formatear en sistemas operativos Windows y Mac.